백혈병 이해 : AML - ETO PCR, blotting

AML1-ETO는 AML의 중요한 기능 재배열인 t(8;21)(q22;q22)로 알려져 있습니다.

AML with recurrent genetic abnormalities (AML with t(8;21)(q22;q22))

 

이 재배열은 AML1(RUNX1) 및 ETO(CBFA2T1) 유전자의 융합을 통해 생성됩니다.

 

AML1-ETO 정량적 PCR 테스트는 AML1-ETO 유전자의 발현 수준을 측정하여 해당 변이의 존재와 정도를 확인하는 데 사용됩니다. 이 테스트는 혈액 또는 골수 샘플에서 유전자 발현 수준을 측정하는 것으로, 이를 통해 AML1-ETO 를 확인할 수 있습니다.

 

AML1-ETO 정량적 PCR 테스트는 AML1-ETO 발현 수준을 정확하게 측정하기 위해 RT-PCR (Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction) 기술을 사용합니다. 이 기술은 mRNA를 cDNA로 역전사한 다음, PCR 반응을 통해 특정 유전자의 존재와 발현 수준을 측정하는 것입니다.

 

AML1-ETO 정량적 PCR 테스트는 AML1-ETO 긍정성을 확인하고 이를 바탕으로 예후를 예측하는 데 중요한 역할을 합니다. 또한 이 테스트는 AML1-ETO 발현 수준을 추적하여 치료 반응을 평가하고 치료 전략을 조정하는 데에도 사용됩니다.

 

AML1-ETO 유전자 발현을 검사하기 위해서는 RT-PCR 방법을 사용할 수 있습니다.

 

1. 샘플 수집: 혈액이나 조직 샘플을 채취합니다.
2. RNA 추출: RNA를 추출하여 순수한 RNA를 얻습니다.
3. cDNA 합성: 추출한 RNA를 역전사 (reverse transcription)하여 cDNA를 합성합니다. 이 단계에서 역전사 효소와 인공적으로 합성된 염기서열인 oligo(dT) primer를 사용합니다.
4. 증폭: cDNA를 사용하여 PCR 증폭을 수행합니다. 이 단계에서는 전용 TaqMan Probes를 사용하여 AML1-ETO 발현 수준을 측정할 수 있습니다.
5. 데이터 분석: PCR 증폭 결과를 정량적으로 분석합니다.

 

이 방법은 정확하고 빠르게 AML1-ETO 발현 수준을 측정할 수 있으며, 유전자 발현의 양적 분석에 유용합니다. 그러나 이 방법은 다른 유전자나 조건에서도 적용할 수 있으며, 샘플 중 RNA의 농도나 품질에 따라 결과가 영향을 받을 수 있으므로 신중하게 접근해야 합니다.

 

AML1-ETO 유전자 발현은 PCR 외에도 다른 방법이 있습니다.

 

일반적으로 유전자 발현을 확인하는 방법 중 하나는 Northern blotting입니다. Northern blotting은 전사체 RNA의 양 및 크기를 분석하여 특정 유전자의 발현을 확인하는 기술입니다.

 

Northern blotting은 RNA를 추출하고 전기영동을 통해 크기별로 분리한 후, 이를 막에 전이시켜 전사체 RNA가 분리된 막에서 특정 전사체 RNA를 검출하는 기술입니다. Northern blotting은 PCR에 비해 더 시간이 오래 걸리고, 상대적으로 덜 정량화되는 단점이 있지만, 다양한 전사체 RNA를 분석할 수 있다는 장점이 있습니다.

 

또한, 최근에는 RNA 시퀀싱 기술을 이용한 RNA 발현 분석 기술도 많이 사용됩니다. RNA 시퀀싱은 다양한 유전자의 발현을 분석할 수 있는 기술이지만, 분석 비용이 높은 단점이 있습니다.

 

이 외에도 Western blotting, in situ hybridization 등의 기술도 유전자 발현을 확인하는데 사용될 수 있습니다.